Thompson svoj privatni život pokušava držati u najstrožoj tajnosti, a posljednje dvije godine puno pozornosti javnosti privukao je nakon što se saznalo da mu je sin Ante Mihael teško bolestan.
Thompson ima petero djece, a dobio ih je u braku sa samozatajnom Sandrom Perković.
Marko i Sandra u braku su od 2003. godine. Ona izbjegava medije i rijetko se pojavljuje u javnosti. O Sandri je poznato da je Kanađanka hrvatskih korijena i da je Marka upoznala na njegovu koncertu u Kanadi, pet godina nakon što se on razveo od pjevačice Danijele Martinović.
Kako bi Sandru odveo pred oltar, Thompson je morao zatražiti crkveno poništenje braka s Danijelom. Nakon što mu je prvi zahtjev odbijen, uputio je i drugi, koji je prihvaćen. Međubiskupijski crkveni sud u Splitu poništio je brak Danijele i Thompsona 2005. godine.
Tri godine nakon sklapanja civilnog braka, Marko i Sandra vjenčali su se u crkvi sv. Ilije u Kljacima nedaleko od Čavoglava, i to na Dan zaljubljenih 2006. godine.
Prvo dijete, sina Šimuna, dobili su 2003. Dvije godine kasnije stigao im je i Ante, zatim su 2007. dobili kćer Divu, a 2010. blizanke Katarinu i Cvitu.
"Tekst te pjesme temeljio sam na osjećaju prema njoj i kroz nju joj htio zahvaliti za svu ljubav koju daje meni i našoj djeci i na podizanju cijele naše velike obitelji. Moja je Sandra cijeli život posvetila meni i djeci, a ta pjesmica samo je jedan mali dio moje zahvalnosti njoj", objasnio je jednom prilikom za "Večernji list", a otkrio je i da je Sandra zaplakala kad je čula pjesmu.
Rijetke fotografije Thompsonove samozatajne supruge pogledajte u našoj galeriji.
Thompson je jedan od svojih najvećih hitova na Trgu s rukometašima otpjevao čak dva puta! Video pogledajte OVDJE.
OVDJE saznajte koje je dirljive riječi uputio Duvnjaku pred krcatim Trgom!
Društvene mreže pune su reakcija na Thompsonov nastup, a više o tome pročitajte OVDJE.