Marin je prvo dijete Tonija i Renate Kukoč. Još u djetinjstvu odlučio je krenuti očevim stopama, ali je nakon niza ozljeda morao odustati od velikog sna. Završio je studij na jednom od najprestižnijih američkih sveučilišta, University of Pennsylvania, a danas živi i radi u Chicagu.
Kukočeva kći Stela ranije se bavila odbojkom, a danas je trenerica odbojke. Završila je studij na Miami Universityju, a trenutno je na magisteriju na Roosevelt Universityju. Iako su djeca poznatog oca, njih dvoje se rijetko pojavljuju u medijima i nemaju otvorene profile na društvenim mrežama.
Košarkaš je svoju suprugu upoznao dok je još bio u srednjoj školi, a on se 1993. godine odselio u Highland Parku pored Chicaga kako bi igrao za legendarne Bullse.